Herramientas

Las sinapsis son elementos clave en la estructura de los circuitos del sistema nervioso y estudiar sus características es extraordinariamente importante.

La herramienta EspINA permite la segmentación y la reconstrucción en 3D de las sinapsis, así como analizar grandes volúmenes de tejido y validar los resultados.

Presentamos un nuevo método con retroalimentación musical para explorar la morfología de la columna dendrítica y los patrones de distribución en neuronas piramidales. Demostramos que el análisis de audio de dendritas espinosas con morfología aparentemente similar puede «sonar» bastante diferente, revelando sustratos anatómicos que no son evidentes a partir de una simple inspección visual.

Esta herramienta presenta una nueva técnica para la generación de modelos tridimensionales de células neuronales a partir de la información morfológica extraída mediante aplicaciones de rastreo asistido por ordenador. Las mallas poligonales 3D que se aproximan a la membrana celular se pueden generar en diferentes niveles de resolución, permitiendo alcanzar el equilibrio entre la complejidad y la calidad del modelo final.

Neuronize implementa un enfoque novedoso para generar una forma 3D realista del soma a partir de la información incompleta almacenada en la neurona trazada digitalmente mediante una técnica de deformación física.

La adición de un conjunto de espinas a lo largo de las dendritas completa el modelo, generando una célula neuronal 3D final adecuada para su visualización en una amplia gama de entornos 3D.

Hemos desarrollado una técnica computacional eficiente para extraer automáticamente la superficie de las uniones sinápticas que previamente han sido reconstruidas tridimensionalmente a partir de muestras de tejido reales obtenidas mediante FIB/SEM automatizado.

Esta técnica se ha incorporado a EspINA y las estructuras SAS se pueden calcular automáticamente a partir de sinapsis reconstruidas.